विधानसभा चुनाव में मुस्लिम यूनिवर्सिटी के मुद्दे ने भी कांग्रेस को काफी नुकसान पहुचाया है। मुस्लिम यूनिवर्सिटी के बयान पर पूर्व सीएम अनशन जहा पहले ही एक लाख रुपए इनाम का एलान कर चुके हैं। तो वही, कांग्रेस के प्रदेश उपाध्यक्ष अकील अहमद द्वारा उठाये गए मुस्लिम यूनिवर्सिटी को लेकर लगातार कर रहे बयानबाजी पर कांग्रेस प्रदेश संगठन ने बड़ी कार्यवाही की है। दरअसल, कांग्रेस ने चुनाव में मुस्लिम यूनिवर्सिटी का मुद्दा उठाने वाले प्रदेश उपाध्यक्ष अकील अहमद को 6 साल के लिए पार्टी से निष्कासित कर दिया है। इस संबंध में कांग्रेस प्रदेश महामंत्री संगठन मथुरा दत्त जोशी ने निष्कासन पत्र भी जारी कर दिया है। जिसके बाद से ही राजनीतिक गलियारों में चर्चाएं तेज हो गई है।